Re: [HTCondor-users] [EXTERNAL] Re: Docker universe filling up machines memory

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Greg

The attachment is the StartLog from one of our nodes

docker ps

CONTAINER IDÂ Â Â Â IMAGEÂ Â Â Â Â Â Â ÂCOMMANDÂ Â Â Â Â Â Â Â Â CREATEDÂ Â Â Â Â Â ÂSTATUSÂ Â Â Â Â Â Â PORTSÂ Â Â Â Â Â Â ÂNAMES

bb90fadec4f4Â Â Â Â ylor/taxonomizrÂ Â Â"./condor_exec.exe 1â"Â Â2 minutes agoÂ Â Â ÂUp 2 minutesÂ Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â Â HTCJob295_193_slot1_3_PID245283

docker images

REPOSITORYÂ Â Â Â Â Â Â TAGÂ Â Â Â Â Â Â Â ÂIMAGE IDÂ Â Â Â Â Â CREATEDÂ Â Â Â Â Â ÂSIZE

ylor/taxonomizrÂ Â Â Â ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â 20f0c5d68ebfÂ Â Â Â 2 days agoÂ Â Â Â Â 5.23GB

<none>Â Â Â Â Â Â Â Â Â <none>Â Â Â Â Â Â Â a80b19de1edaÂ Â Â Â 2 days agoÂ Â Â Â Â 5.2GB

<none>Â Â Â Â Â Â Â Â Â <none>Â Â Â Â Â Â Â d502bef98f93Â Â Â Â 7 days agoÂ Â Â Â Â 1.11GB

eweiser/rlme4Â Â Â Â Â ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â 6951fde34740Â Â Â Â 4 weeks agoÂ Â Â Â Â1.04GB

raerickson/r-stanÂ Â Â ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â 8250dff612f8Â Â Â Â 2 months agoÂ Â Â Â 2.36GB

hello-worldÂ Â Â Â Â Â ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â fce289e99eb9Â Â Â Â 4 months agoÂ Â Â Â 1.84kB

rerickson/r-stanÂ Â Â Â latestÂ Â Â Â Â Â Â e53f978e52c3Â Â Â Â 7 months agoÂ Â Â Â 922MB

<none>Â Â Â Â Â Â Â Â Â <none>Â Â Â Â Â Â Â acff3023d3ddÂ Â Â Â 7 months agoÂ Â Â Â 1.03GB

christinalk/qiime-rÂ Â Âv1.1Â Â Â Â Â Â Â Â db94721c7427Â Â Â Â 9 months agoÂ Â Â Â 7.21GB

ylor1/qiime2_ampliconÂ ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â 58da8aa446f5Â Â Â Â 10 months agoÂ Â Â Â7.25GB

ylor1/qiime1_ampliconÂ ÂlatestÂ Â Â Â Â Â Â c2731d36a347Â Â Â Â 10 months agoÂ Â Â Â5.2GB

r-baseÂ Â Â Â Â Â Â Â Â latestÂ Â Â Â Â Â Â 3cb19d246267Â Â Â Â 12 months agoÂ Â Â Â701MB

eweiser/rspatialgrtsÂ Â latestÂ Â Â Â Â Â Â f0436d9ef467Â Â Â Â 14 months agoÂ Â Â Â1.51GB

eweiser/rspatialÂ Â Â Â latestÂ Â Â Â Â Â Â c20e89afe36fÂ Â Â Â 14 months agoÂ Â Â Â1.46GB

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Thanks

Mel

On Thu, May 2, 2019 at 9:34 AM Greg Thain <gthain@xxxxxxxxxxx> wrote:

On 5/2/19 9:14 AM, Erickson, Richard via HTCondor-users wrote:

Hi,

I searched through email list and could not find this issue.

HTCondor should be cleaning up after itself.Â My first question would be if it is leaking images or containers.Â The command docker ps or docker images should tell you.Â If you could send me a StarterLog.slotXXX (off list), I will look to see if anything out of the ordinary is going on.

-greg

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